Hola kiquenet kiquenet para gestionar una tarea programada dependerá de cómo ejecutes Docker.

Por ejemplo si usar docker-compose simplemente tienes que crear una tarea programada en el cron de la máquina donde ejecutas docker compose que lance el comando con docker exec [nombre del contenedor] [comando a ejecutar].

Si usas AWS ECS tendrás que usar las scheduled tasks https://docs.aws.amazon.com/AmazonECS/latest/developerguide/scheduling_tasks.html

Si usas Swarm o Kubernetes tendrás que usar las herramientas de cada sistema. No tengo experiencia con ellas así que no te puedo dar mas información.